Intern
  • Superposition of Cathepsin K and other proteases (Image: Natalia Yuan Chen)
  • Structure of AAA+ ATPase p97 (PDB 5C1B) (Image: Natalia Yuan Chen)
The Sotriffer Group: Computational Medicinal Chemistry

Alumni and Graduates

PhD (Dr. rer. nat.)

Dr. Carina Herbst

2024

Strukturbasiertes Wirkstoffdesign: Evaluierung von Fragment-Docking Protokollen, Analyse der Struktur-Wirkungs-Beziehungen von Mip-Inhibitoren und Screening nach Inhibitoren der Vaccinia virus RNA-Polymerase

Dr. Erik Endres

2024

Kovalente Inhibitoren: Modellierung und Design

Dr. Stephan Böhler

2024

Strukturbasiertes Design von Liganden zur kovalenten Adressierung der SHP-Cofaktorbindestelle von p97

Dr. Markus Zehe

2023

Fragment-basierte Entwicklung von Liganden des Chaperons Hsc70

Dr. Mathias Diebold

2023

Virtuelles Screening und Entwicklung selektiver Liganden des Aurora-A – MYCN Komplexes und computergestützte Methoden zur Analyse und Design von PROTACs

Dr. Josef Kehrein

2022

Simulationsstudien zur ortsspezifischen Biokonjugation maßgeschneiderter Polymere

Dr. Sebastian Bothe

2021

Fragmentbasiertes Design von p97-Liganden: Identifizierung von Startstrukturen zur Entwicklung von Protein-Protein-Interaktionsinhibitoren für die SHP-Bindestelle der AAA+ ATPase p97

Dr. Yesid Ramirez
(co-supervision)

2019

Structural basis of ubiquitin recognition and rational design of novel covalent inhibitors targeting Cdu1 from Chlamydia trachomatis

Dr. Maximilian Kuhn

2018

Strukturbasiertes Design von MIP-Inhibitoren und computergestützte Selektivitätsuntersuchung gegenüber MIP- und humanen FKB-Proteinen

Dr. Christina Plank

2018

Untersuchung von Dihydroisochinolinonderivaten als mögliche Inhibitoren von Hsc70

Dr. Yogesh Narkhede

2017

In silico structure-based optimisation of pyrrolidine carboxamides as Mycobacterium tuberculosis enoyl-ACP reductase inhibitors

Dr. Ulrich Peinz

2017

Strukturbasiertes computergestütztes Wirkstoffdesign an flexiblen Proteintargets: Aldose Reduktase und Hsp70

Dr. Sarah Wehle 
(co-supervision)

2016

In silico Studien zu Bis-Tacrinen, Chinazolinen und Chinazolinonen sowie Synthese von Chinazoliniumverbindungen als Inhibitoren von Cholinesterasen

Dr. Benjamin Merget

2015

Computational methods for assessing drug-target residence times in bacterial enoyl-ACP reductases and predicting small-molecule permeability for the Mycobacterium tuberculosis cell wall

Dr. David Zilian

2014

Neuartige, empirische Scoring-Modelle für Protein-Ligand-Komplexe und computergestützte Entwicklung von Hsp70-Inhibitoren

Dr. Michael Hein

2014

Entwicklung computergestützter Methoden zur Bewertung von Docking-Lösungen und Entwurf niedermolekularer MIP-Inhibitoren

Dr. Johannes Schiebel 
(co-supervision)

2013

Structure-Based Drug Design on Enzymes of the Fatty Acid Biosynthesis Pathway

Dr. Armin Welker 
(co-supervision)

2013

Theoretische und experimentelle Wirkstoffsuche an den Zielproteinen SARS-Coronavirus-Papain-like-Protease und Elongin-C

Dr. Christine Topf
(co-supervision)

2013

Design, Synthese und biologische Testung von KasA-Inhibitoren als potentielle Wirkstoffe gegen Mycobacterium tuberculosis

Dr. Benjamin Schaefer

2013

Computergestützte Untersuchungen zur Inhibition und Dynamik der β-Ketoacyl-ACP-Synthase I (KasA) aus Mycobacterium tuberculosis

Dr. Constanze Waltenberger

2012

Virtuelles Screening nach einer neuen Inhibitorklasse der Enoyl-ACP-Reduktase InhA aus Mycobacterium tuberculosis

Dr. Monika Nocker

2012

Molekulardynamische Untersuchungen zur Charakterisierung von Flexibilität, Binde-mechanismen und Bindungsaffinitäten von Aldose Reduktase und Nukleären Rezeptoren

Dr. Daniel Cappel

2011

Computersimulationen zur Untersuchung von Wassermolekülen in Protein-Ligand-Komplexen am Beispiel einer Modellbindetasche

Dr. Martin Sippel

2010

Computational Structure-based Design Approaches: Targeting HIV-1 Integrase and the Macrophage Infectivity Potentiator of Legionella pneumophila

 

Master (M.Sc.)

Wilhelm Neumann

2025

Quantum chemical investigation of cholinesterase inhibition by carbamates: Model reactions for decarbamylation

Rebecca Würz

2024

Targeting the MYC interacting protein RuvBL1/2: Virtual screening for ATP competitive inhibitors and design of PROTACs

Marius Schlagmüller

2023

Entwicklung eines Virtual-Screening-Workflows für GPCR-Targets am Beispiel des β2-Adrenozeptors

Sebastian Kolle

2023

Analyse und Design molekularer Screening-Bibliotheken mittels Python-basierter Chemoinformatik-Tools

Sara Endres 

2022

Virtuelles Fragmentscreening: Untersuchung zur Leistungsfähigkeit von Docking­ver­fahren im Vergleich zu experimentellen Methoden   am Beispiel von Endothiapepsin

Stephan Boehler

2020

Strukturbasierte Entwicklung kovalenter p97-Inhibitoren

Gerald Keller

2019

Simulationsstudien zur Bindungskinetik von Proteinkinase A Inhibitoren

    Erik Endres

2019

MD-Profilierung nichtkovalenter Anlagerungskomplexe von kovalenten Inhibitoren des Cathepsin K

Mathias Diebold

2017

Virtuelles Screening nach Liganden des Aurora-A/N-Myc-Komplexes

Dominik Heuler

2016

Parameterstudien und Analysen von MD-Simulationen kovalenter Protein-Ligand-Komplexe

Dmytro Mykhailenko

2016

Untersuchung kovalenter Docking-Methoden

Lukas Pason

2015

Ansätze zur Verbesserung empirischer Scoringfunktionen für Protein-Ligand Komplexe

Thomas Willmes

2012

Strukturbasiertes Wirkstoffdesign kovalent-reversibler Inhibitoren

Manuel Krug

2011

Berücksichtigung intramolekularer Terme im Scoring von Protein-Ligand-Komplexen

Bachelor (B.Sc.)

Jo Gräßlin

2019

Virtual screening for ligands of phosphoglycolate phosphatase

Thomas Niepel

2014

Die Bedeutung des Protonierungszustands von Lys165 für Struktur und Funktion der Enoyl-ACP-Reduktase InhA: Vergleichende Analyse von Molekulardynamik Simulationen